Upptäckten av en genetisk variant som är relativt vanlig hos människor av polynesisk härkomst, men otroligt sällsynt i de flesta andra populationer, ger ledtrådar till den genetiska grunden för högt kolesterol hos alla individer, enligt ny forskning från University of Pittsburgh School of Public Health Genetiker i samarbete med flera andra grupper, inklusive University of Otago och Samoan Health Research Community.
Den överraskande upptäckten, publicerad denna vecka i tidskriften Framsteg inom mänsklig genetik och genomikvisar vikten av att säkerställa mångfald i genetiska databaser.
Om vi bara hade letat efter populationer av europeiska härkomster, hade vi kanske helt missat detta fynd. Det är tack vare tusentals polynesiers generositet som vi kunde hitta denna variant, vilket är ett obestridligt bevis som kommer att väcka ny forskning om biologin bakom kolesterol. »
Jenna Carlson, Ph.D., huvudförfattare, biträdande professor i human genetik och biostatistik, Pitt Public Health
Hyperkolesterolemi är en ledande orsak till sjukdomsbördan i länder med alla inkomstnivåer, är en riskfaktor för hjärtsjukdomar och stroke och beräknas orsaka 2,6 miljoner dödsfall årligen i världen, enligt Världshälsoorganisationen.
Carlson och hans team byggde sin studie för att utforska en signal som dök upp i en stor genomomfattande undersökning som letade efter gener associerade med lipider, eller fetter, i kroppen. Han föreslog att en genvariant på kromosom 5 kan vara associerad med kolesterol. Teamet satte sig för att “fint kartlägga” regionen med hjälp av genetiska data från 2 851 samoanska vuxna från Obesity, Lifestyle and Genetic Adaptations Study Group (OLAGA, vilket betyder “liv” på samoanska) som också hade tillhandahållit hälsoinformation, inklusive lipidpaneler. För att dubbelkolla fyndet letade teamet efter associationen hos 3 276 andra polynesier från Samoa, Amerikanska Samoa och Aotearoa på Nya Zeeland, och samma koppling mellan varianten och kolesterol observerades hos dem.
Med hjälp av data från de västpolynesiska samoanska deltagarna kunde teamet fylla i saknad information kring regionen de var intresserade av på kromosom 5. Detta ledde dem till BTNL9 – en gen som styr produktionen av proteinet BTNL9. Proteiner signalerar vanligtvis celler att utföra åtgärder, även om forskare ännu inte har karakteriserat den exakta rollen för BTNL9-proteinet.
Det visade sig att polynesier med låga nivåer av “bra” HDL-kolesterol och höga nivåer av triglycerider hade en “stop-gain”-variant i BTNL9, vilket betyder att genen var riktad att sluta göra sitt jobb med proteinproduktion, en stark indikation på att BTNL9 protein hjälper celler att upprätthålla sunda kolesterolnivåer.
“Vi vet inte mycket om den här varianten eftersom den inte förekommer i publicerade genomiska referenser, som överrepresenterar individer av europeisk härkomst – den är praktiskt taget obefintlig i populationer av europeisk härkomst, har en mycket låg frekvens hos sydasiater och är inte ens särskilt vanligt hos östpolynesier, som maorier som bor i Aotearoa på Nya Zeeland,” sa Carlson. “Men sättet det är kopplat till lipidpaneler på Samoans säger oss att den här genen är viktig för kolesterol, något vi inte visste tidigare. Genom att ytterligare utforska BTNL9 kan vi en dag upptäcka nya sätt att hjälpa alla att behålla hälsosamma kolesterolnivåer .”
Källa:
Journalreferens:
Carlson, J.C. et al. (2022) En stop-gain-variant av BTNL9 är associerad med aterogena lipidprofiler. Human genetik och framsteg inom genomik. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.